Ordre 66 , tel que décrit dans les années 2005 Star Wars : La Revanche des Sith , était une trahison choquante, alors que les soldats clones à travers la galaxie se sont retournés contre les Jedi qui, quelques instants plus tôt, étaient leurs camarades et leurs dirigeants dans la guerre contre les forces séparatistes. Le seul acte plus perfide fut l'attaque du Temple Jedi sur Coruscant, dirigé par Anakin Skywalker , qui a entraîné le massacre d'innombrables padawans et jeunes. Cependant, les clones ont joué un autre rôle dans ce siège, détaillé dans une séquence coupée du film.
Publié sous forme inachevée en 2010 , et développée dans la novélisation du film (qui n'est plus considérée comme un canon), la scène montre la pire et la plus douloureuse trahison des Clone Troopers alors qu'un détachement a enfilé les robes de l'Ordre pour tendre un piège à tout Jedi qui a répondu appeler pour rentrer à la maison. Ce stratagème semble encore plus sinistre que les exécutions sur les champs de bataille.
Dans la scène incomplète, Obi-Wan Kenobi et Yoda retournent au Temple Jedi, où ils sont accueillis par les imposteurs. Obi-Wan dit: 'Vous, les clones, faites de terribles Jedi', avant que les clones ne tirent leurs blasters sur les deux maîtres Jedi. Bien sûr, Yoda et Obi-Wan sont plus rapides et ils abattent facilement les clones.
La novélisation fournit des détails supplémentaires, révélant que les faux Jedi sont huit membres de Leurre Escouade Cinq , un détachement de la 501e Légion sous la direction d'Anakin Skywalker. Cependant, dans la séquence en prose, Obi-Wan et Yoda déploient leur propre tromperie : Obi-Wan prétend être un mendiant sans abri avec un jeune Jedi - c'est-à-dire un Jedi - cherchant refuge dans le temple. Lorsque les clones cherchent la preuve que l'enfant est un Jedi, Yoda passe à l'action en disant : Mon sabre laser, le premier indice serait, hmm ?
Obi-Wan cherche néanmoins à empêcher toute violence, mais les clones tirent quand même leurs blasters. « Six secondes plus tard », déclare le roman, « ils étaient tous les huit morts.
L'utilisation des robes Jedi dans le stratagème devient plus sinistre et déchirante après une réflexion plus approfondie: les clones ont probablement retiré les robes des corps des Jedi qu'ils avaient assassinés quelques instants avant cette altercation. Mais même si les robes n'avaient pas été retirées des morts, elles appartenaient toujours aux Jedi mêmes que les clones avaient trahis. Ces robes sont un symbole de leur ordre et sont censées symboliser la paix, pas la tromperie.
L'Ordre 66 a presque complètement anéanti les Jedi, et les quelques survivants de l'Ordre doivent non seulement vivre avec cet échec, mais aussi en sachant qu'ils ont été détruits par ceux en qui ils avaient confiance.
